Экологическая структура микробного ценоза общественного автотранспорта

Впервые охарактеризован микробиологический «пейзаж» обсемененности салонов пассажирского автотранспорта на примере 41 автобуса 16 маршрутов, из которых в соответствии с орографическими особенностями г. Нижнего Новгорода были сформированы три модельные группы автобусных маршрутов: «Нагорная», «Заречная» и «Межрайонная». С помощью времяпролетного MALDI масс-спектрометра Autoflex (Bruker Daltonics, Германия) и программного обеспечения BioTyper идентифицированы численность и видовой состав микроорганизмов. В отобранных пробах обнаружены и идентифицированы 85 видов микроорганизмов, которые по степени патогенности были отнесены к одной из трех групп:

1) условно-патогенных микроорганизмов, часто вызывающих инфекционные заболевания;

2) условно-патогенных микроорганизмов, редко вызывающих инфекционные заболевания;

3) непатогенных микроорганизмов. Для характеристики экологической структуры микробного ценоза городского общественного автотранспорта рассчитаны индексы видового сходства: бинарный (индекс Серенсена) и многомерный (индекс биотической дисперсии Коха) сравниваемых объектов, в качестве которых выступали видовые списки микроорганизмов. Видовые списки анализировали на различных иерархических уровнях групп маршрутов: внутригрупповом и межгрупповом. На внутригрупповом уровне обнаружено небольшое число общих видов (1 - 3 вида) в каждой из сравниваемых групп, представленных Staphylococcus epidermidis, Staphylococcus haemolyticus и Acinetobacter Iwoffii, что соответствует низкому значению индекса Коха, равному 0.10. При переходе на межгрупповой иерархический уровень маршрутов было выявлено уже 15 общих видов микроорганизмов, что соответствует значению индекса Коха, рассчитанному для трех групп маршрутов, равному 0.26. Другими словами, в трех анализируемых группах маршрутов обнаружено уже 26% общих видов микроорганизмов. При этом наиболее полно представлены все три группы микроорганизмов в «Межрайонной» группе маршрутов: 1-я группа - 45.0%; 2-я группа - 53.8% и 3-я группа - 58.1%. Синэкологический анализ, проведенный с применением экологических индексов - видового разнообразия Шеннона, доминирования Симпсона, видового богатства Маргалефа и выравненности Пиелу - показал, что увеличение видового разнообразия сообществ микроорганизмов сопровождается закономерным снижением доминирования и возрастанием выравненности. Анализ группы доминантных видов, идентифицированных в автобусах трех маршрутных групп, выявил, что видовое сходство по доминантным видам, оцениваемое по значению индекса Коха, составляет всего 0.14, что объясняется наличием только одного общего вида - Acinetobacter twoffii. Изучение микробиоценозов городского автотранспорта представляет перспективу для решения санитарно-гигиенического и экологического аспектов комплексной проблемы обеспечения экологической безопасности городской среды.

1. Белова И. В., Точилина А. Г., Соловьева И. В, Жирнов В. А, Иванова Т. П, Сидорова В. Ф, Балавина Т. К. Взаимодействие Регионального научно-методического центра по мониторингу за актуальными для ПФО инфекционными болезнями и бактериологических лабораторий. Опыт применения масс-спектрометрии // Справочник заведующего КДЛ. М. : Изд. дом МЦ ФЭР, 2015. № 11. С. 33 - 41.

2. Любимова А. В., Зуева Л. П, Голубкова А. А., Техова И. Г. Гигиена рук медицинского персонала. Федеральные клинические рекомендации. М. : Ремедиум Поволжье, 2014. 31 с.

3. Левин А. П. Структура экологических сообществ. М. : Изд-во МГУ, 1980. 181 с.

4. МУ № 2657-82. Методические указания по санитарно-бактериологическому контролю на предприятиях общественного питания и торговли пищевыми продуктами. М., 1982. 26 с.

5. МУК № 4.2.2942-11. Методы санитарно-бактериологических исследований объектов окружающей среды, воздуха и контроля стерильности в лечебных организациях / Фед. центр гигиены и эпидемиологии Роспотребнадзора. М., 2011. 7 с.

6. Потатуркина-Нестерова Н. И., Фалова О. Е., Немова И. С., Онищенко Н. С. Микробиота кожи в норме и патологии. Ульяновск : Изд-во Ульян. гос. техн. ун-та, 2014. 113 с.

7. Мэгарран Э. Экологическое разнообразие и его измерение. М. : Мир, 1992. 184 с.

8. Одум Ю. Экология : в 2 т. / пер. с англ. М. : Мир, 1986. Т. 1. 328 с.; Т. 2. 376 с.

9. Покровский В. И., Акимкин В. Г., Брико Н. И, Брусина Е. Б, Благонравова А. С., Зуева Л. П., Ковалишена О. В, Стасенко В. Л., Тутельян А. В., Фельдблюм И. В., Шкарин В. В. Основы современной классификации инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи // Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. 2011. № 3. С. 4 - 10.

10. Руководство по инфекционным болезням / под ред. Ю. В. Лобзина. СПб. : Фолиант, 2003. 1040 с.

11. СП 1.3.3118-13. Санитарно-эпидемиологические правила. Безопасность работы с микроорганизмами I - II групп патогенности (опасности). Приложение 3. Классификация биологических агентов, вызывающих болезни человека, по группам патогенности. М., 2013. С. 70 - 84.

12. Abrams B. L., Waterman N. G. Dirty money // J. of the American Medical Association. 1972. Vol. 219, iss. 9. P. 1202 - 1203.

13. Afshinnekoo E., Meydan C., Chowdhury S., Jaroudi D., Boyer C., Bernstein N., Maritz J. M., Reeves D., Gandara J., Chhangawala S., Ahsanuddin S., Simmons A., Nessel T., Sundaresh B., Pereira E., Jorgensen E., Kolokotronis S. O., Kirchberger N., Garcia I., Gandara D., Dhanraj S., Nawrin T, Saletore Y, Alexander N, Vijay P., Henaff E. M, Zumbo P., Walsh M, OMullan G. D, Tighe S., Dudley J. T., Dunaif A., Ennis S., OHalloran E., Magalhaes T. R., Boone B., Jones A. L., Muth T. R., Paolantonio K. S., Alter E., Schadt E. E., Garbarino J., Prill R. J, Carlton J. M., Levy S, Mason C. E. Geospatial Resolution of Human and Bacterial Diversity with City-Scale Metagenomics // Cell Systems. 2015. Vol. 1, № 1. P. 1 - 15.

14. Luckey T. D. Introduction to intestinal microecology // American J. of Clinical Nutrition. 1972. Vol. 25, iss. 12. P. 1292 - 1294.

15. Maritz J. M., Sullivan S. A., Prill R. J., Aksoy E., Scheid P., Carlton J. M. Filthy lucre: A metagenomic pilot study of microbes found on circulating currency in New York City // PLoS ONE. 2017. Vol.12, iss. 4. P. e0175527.

16. Pereira da Fonseca T. A., Pessoa R., Sanabani S. Molecular analysis of bacterial microbiota on brazilian currency note sur faces // International J. of Environmental Research and Public Health. 2015. Vol. 12, № 10. P. 13276 - 13288.

17. Pielou E. C. The measurement of diversity in different types of biological collections // J. of Theoretical Biology. 1966. Vol. 13. P. 131 - 144.

18. Sender R., Fuchs S., Milo R. Revised Estimates for the Number of Human and Bacteria Cells in the Body // PLoS Biology. 2016. Vol. 11, iss. 8. P. e1002533.

19. Snyder W. S., CookM. J., Nasset E. S., Karhausen L. R., Parry Howells G., Tipton I. H. Report of the Task Group on Reference Man. Oxford : Pergamon Press, 1975. 480 р.

20. Vriesekoop F., Russell C, Alvarez-Mayorga B., Aidoo K, Yuan Q., Scannell A, Beumer R. R, Jiang X., Barro N., Otokunefor K, Smith-Arnold C. D. Dirty money : an investigation into the hygiene status of some of the world’s currencies as obtained from food outlets // Foodborne Pathogens and Disease. 2010. Vol. 7, iss. 12. P. 1497 - 1502.